Jeden rok po udalostiach so 10 miliardami jenov začína Kazuma Kiryu budovať pokojný život s Harukou Sawamurovou. Čoskoro je však vytrhnutý z tejto idyly, keď hrozba atentátu sa vyhráža rozsiahlou vojnou medzi klanom Tojo a alianciou Omi. Kiryu, Drak z Dojimy, musí cestovať do Sotenbori v Osake a pokúsiť sa vyjednať mier medzi rivalmi, ale Ryuji Goda, známy ako Drak z Kansai, urobí všetko pre to, aby začala vojna. V tomto svete môže byť iba jeden drak.
Yakuza Kiwami 2 bola znovu postavená od základu a používa Dragon Engine na aktualizáciu jedného z výrazných dielov série do moderného klasického poňatia. Hráči si môžu zahrať obľúbené minihry, vrátane aktualizovaných verzií simulátora Cabaret Club a tvorby klanu, alebo vyskúšať úplne nové prídavky, ako je golf bingo a Toylets. Novinkou v Kiwami 2 je aj 'Majima Saga', ktorá prináša príbeh, kde si hráči zahrajú za Goru Majimu a odhalia udalosti predchádzajúce hre.
